释迦摩尼死后他的弟子从灰烬中拣出了一块头顶骨、两块肩胛骨、四颗牙齿和一节指骨，现在供奉在法门寺的就是这唯一的一节指骨。在唐代还奉指骨舍利为护国真身舍利，曾经6次被请进皇宫供奉。后来一直被深埋在法门寺地宫中，直到1987年发现法门寺唐代地宫，这沉睡了一千多年的指骨舍利才得以重见天日。
法门寺地宫共藏有佛指骨舍利4枚，其中真身灵骨一枚，其余3枚是影骨。有人说这是一真三假。其实，佛教界认为，假也非假，影骨同为佛界灵物。
真身灵骨为乳黄色，出土时有白色霉点附着其上，有裂纹，有蜡质感，当时因液体浸泡千百年骨质发软不能触摸。灵骨之外的3枚影骨，均为玉质。由于历史上曾出现过多次“灭佛”运动，玉质影骨是为了保护真身佛指骨舍利特制的。晚唐时期的武宗李炎曾敕令毁碎佛指骨舍利，但受命者只是毁了影骨，而将真正的灵骨密藏起来，到咸通年间才又重新在密道中找到。
从古至今，几乎无人怀疑佛指骨舍利的真实性。释迦牟尼佛于公元前485年涅盘，这枚指骨历时近25个世纪，它能存在至今确实是个奇迹。