我们在念诵药师经之后是可以回向给自己，回向文是可以直接用自己的心愿就可以了，但是我们一定要诚心的回向，把回向文念的清楚一些。为了我们回向的功德能够更加的多，一定要知道有哪些注意事项，避免有不恭敬佛菩萨的情况发生。
诵药师经是对十方三世诸佛菩萨智慧的汲取，既然是在学习诸佛菩萨的智慧，就应有庄重之心对待诵经这个殊胜的事，切不可嬉笑打闹，敷衍了事。
诵药师经时要焚香，坐姿端正，不可随意坐卧，要用恭敬之心对待。诵经要用平和的心，保持气息，要心口合一，不可草草涉读。经书要保持干净，不能在上面乱涂乱画，写字做笔记。
最后，我们诵读完药师经得到功德后，一定要记得回向给众生，利益众生。我们回向众生并不会让我们的功德减少，反而因为我的慈悲心会增长我们的功德，生出无限智慧，为自己为家人种下福田，广增功德，早证菩提。
我们在念诵药师经的过程中，是要知道药师琉璃光如来本愿功德经仪轨是什么，这样才能够更好的体会到经文中的内容是什么，以及我们能够体会到哪些功德和好处。