天台宗将毗卢遮那作为法身，与卢舍那(报身佛)、释迦(应身佛)合为三身。法相宗亦有三身说，只是名称不同，他们把毗卢遮那佛作为自性身，以卢舍那佛为受用身，以释迦佛为化身。
华严宗则根据《华严经》认为毗卢遮那佛就是卢舍那佛，两者只是译名不同罢了。他们还认为此佛即《华严经》中所说的释迦佛的报身净土莲华藏世界的教主。
佛有三身，分别是：毗卢遮那佛、卢舍那佛和释迦牟尼佛。
法身佛：毗卢遮那佛(即大日如来)，为即是中道之理体也，佛以法为身，故称法身，法身处于常寂光净土。
报身佛：卢舍那佛，义曰：光明遍照，又作“净满”。报身佛是表示证得了绝对真理获得佛果而显示了佛的智慧的佛身。是行六度万行功德而显佛之实智也。对于初地以上菩萨应现之报身，报身处于实报庄严土。
应身佛：释迦牟尼佛，是表示随缘教化，度脱世间众生而现的佛身，特指释迦牟尼的生身。 大日如来依梵音可译成毗卢遮那佛，“如来”即是“佛”的意思。