马头明王心咒注音：
唵ong 班ban 札zha 卓zhuo 达da 哈ha 呀ya 桌zhuo 哇wa 呼hu 噜lu 呼hu 噜lu 吽hong 呸pei
降伏罗刹、鬼神、天龙八部之一切魔障，清除无明业障，瘟疫、病苦，免一切恶咒邪法。
佛经中讲：马头明王的主要功德为：降伏罗刹，鬼神，天龙八部之一切魔障，消除无明业障，瘟疫，病苦，免一切恶咒邪法，故有许多法器，马头明王金刚橛上安置本尊的头像!此莲花马头金刚陀罗尼为七佛所说，诵一遍便解脱一切罪业，能塞恶趣之门，龙等诸魔不能害，解脱毒害诅咒，一切祸殃等。
一切诸佛慈悲摄受，能使分争合好等，且无量功德也，若诵一遍，除一切罪恶，诵二遍，得吉祥.诵十万遍，得长寿.诵百万遍，亲见本尊，往生莲花刹土。并说：此咒能治龙魔所致心，不欢喜等身病，肿瘤，尿频，半身枯萎，疗毒，热邪麻疯，毒病，等种种病，并能抵制一切邪魔，此法亦能解龙魔诅咒之害也。