辟谷可以健脑益智、开发人体潜能，提升心能量、增强心场能的作用。由于去掉了体内多余的脂肪和毒素，体内得到了全面的清洁，肠胃得到了调节和休养，心灵因而得到澄清和升华。性情得以陶冶，视野载阔，了悟人生，明悟真理。使人产生新的人生观和世界观，对宇宙和自然有了全新认识。
从现代医学看，人的肝脏是一个生化工厂，既是消化器官，也是解毒器官，正常人进食后，无论有毒无毒的成人，都要肝脏分解或化合处理后才能进入人体血液，辟谷由于进食很少，肝脏负担变轻，会回过头来清除血液里的毒素，使毒素深度降低，同时合成有益于身体免疫的活性物质。例如，辟谷后，血液中高密度脂蛋白会升高，高密度脂蛋白能降低血脂，修复血管硬化，逆转冠心病、高血压。
辟谷还具有更深的一层意义，它不是纯粹的挨饿，而是具备了练功而带来的特殊效果。中国辟谷理论认为每个人的身体都有一套阳性系统和阴性系统。阳性系统就是我们日常一直在用的，比如说整个的消化系统；而辟谷是用一套方法，关闭阳性系统（同时使胃酸停止分泌），开启阴性系统。
在这个状态下，大脑始终处在一种全新的功能态，体能和潜力得到了充分的调节和发挥，身体方面的负荷得到减轻，元神得到最充分的运用和发挥，脑细胞的功用充分得到调动，因此，人与自然宇宙沟通活跃，外界的多种信息源源不断地输入大脑，此即天人合一。
因此，人在这个状态下，即使好几天不进食，也不会感到饥饿，体力和精神状态反而会加强。这些表现在肢体灵活、双目有神、头脑清晰、思维敏捷，记忆力增强、理解力增强、意志力和忍耐力也大大加强，极易启发和诱发人体种种潜能。同时，也产生对宇宙真谛的思索和理解，以致可以产生各种特异思维，解决许多常态下无法解决的问题和困惑，终将导致灵力和智慧的飞跃，灵感也随之而产生。
但是，中国古代留下来的学说很多，有些近于玄说，这种阴性系统也终究未能被人证明，也没有人能够终生不进食而可以辟谷存活，很多辟谷者对此过于相信，强行辟谷，导致发生身体损害的例子枚不胜举。